小次郎編
ありきたりの家出人探しから物語りは始まる。親子関係のゆがみからの家出か?それとも誘拐か?情報を集めていくうちに、いつの間にか追うものから追われるものへ。ほんの些細な依頼から、今まで見えなかった陰謀が一つ、また一つとあらわになっていく。
まりな編
VIPのボディーガードを勤める傍ら、少女の保護を請け負うまりな。エスカレートする殺人事件、狙われる少女、そして自分がガードするはずであるVIPの不審な行動。やがてそれらは次第に一つの大きなことになって姿を現し始める。
PS版「EVE ZERO」よりも画像やアニメーションがきれいになっている。また、PS版よりもエンディングの種類が増えている。
フォーカスモードがあり、特定のキャラと2人だけで会話ができ、その後のストーリーに影響がでてくる。このモードでしか聞けない話があります。